Ένα από τα πιο θεμελιώδη και παράξενα μυστήρια του Σύμπαντος είναι η ίδια του η ύπαρξη. Όταν συνέβη η Μεγάλη Έκρηξη θα έπρεπε να έχουν δημιουργηθεί ίσες ποσότητες ύλης και αντιύλης και όταν ύλη και αντιύλη συναντώνται αλληλοεξουδετερώνονται.
Υπάρχει στο Σύμπαν η συμβατική, ορατή ύλη όπως τα αέρια, η κοσμική σκόνη, τα άστρα, οι πλανήτες και οι γαλαξίες. Υπάρχει επίσης η αόρατη σκοτεινή ύλη γνωστή μόνο λόγω των βαρυτικών της επιδράσεων σε μεγάλη κλίμακα. Υπήρχε μέχρι σήμερα και η αποακλούμενη «χαμένη» ύλη την οποία ερευνητές υποστηρίζουν ότι εντόπισαν.
